Ano, SD karta může být ještě NTFS nebo UDF. Cokoliv jiného se Windows při vložení té karty do počítače pokusí zformátovat s tím, že je ta karta prázdná. NTFS v Linuxu nefunguje hlavně kvůli tomu, že MS odmítá licencovat specifikace (zlé jazyky tvrdí, že ani neexistuje), a UDF sice umí práva, ale Windows je u všech změněných souborů a adresářů úspěšně zničí (bravo, MS!). Navíc většina wear leveling systémů pro SD karty je navržena pro FAT a s jiným souborovým systémem nebude fungovat správně.
Android stále používá FAT či exFAT pro SD karty.