Názor k článku Calibre: švýcarský nůž do elektronické knihovny od Veterán - Jestli máte možnost uložit dokument jako DOCX, tak...

Jestli máte možnost uložit dokument jako DOCX, tak použijte EPUBGen (http://code.google.com/p/epub-tools/). Ve Wordu si nastavte ukládání včetně fontů a myší pak soubor přetáhněte na spuštěnou java aplikaci.
Pro stávající EPUB je asi z toho co znám nejjednodušší SIGIL, který umí fonty vkládat, ale je pak třeba ručně upravit css styly.
Největší problém ale je, že některé čtečky na vložené fonty kašlou a berou to, co mají ve svém nastavení. Pak už nepomůže asi nic jiného než PDF.