Pár jsem jich zkusil a nakonec jsem zůstal u gnome-paint:
http://code.google.com/p/gnome-paint/
Neumí sice skoro vůbec nic (zatím ani psaní textu) a občas spadne, ale na nějaké rychlé nakreslení schématu to stačí. Rozhraním se celkem podobá právě Malování z Windows.