Je rozdíl mezi tím, zda klonujete celý disk, nebo jen oblast/i.
Svou roli může hrát geometrie disku.
A pak také, Widle mají v registrech uložené informace o rozdělení disku (o sektorech kde oblasti začínají a končí) a přidělení písmenek jednotkám.
Tuhle část když z registrů smažete, tak si ji při dalším spuštění znovu nadetekují. Pokud ji tam už mají a změní se jim (například klonováním) tak se jim to nelíbí a chcípají na to.
Bohužel už jsem se v tom dlouho nevrtal, tak nevím ve kterém klíči je to uložené, ale nebylo to moc hluboko zanořené.