Pokud SW počítá s tím že cesty na FS nejsou case sensitive, a běží na OS který je case sensitive nemá, tak nevidím problém. Horší je pokud SW například neumí fungovat s názvy adresářů/souborů obsahujícími mezery, i pokud to FS umožňuje. A to byl dlouhá léta problém třeba pro Oracle. Mám za to, že teď už se konečně dají binárky Oraclu nainstalovat do Program Files, ale tím to bohužel končí. A to zdaleka není jediná unixová aplikace, která má tenhle problém :/