Putty je na tom obdobně, neboť ukládá klíče (privátní i veřejný) do souboru .ppk. Heslo pro šifrování privátního klíče se generuje pomocí algoritmu SHA-1 z heslové fráze, kterou zadá uživatel; viz How does Putty derive the encryption key in its .ppk format? Operace SHA-1 se provede třikrát.
Bezpečnost uložení lze zlepšit pomocí aplikací, které umí simulovat funkčnost pagent: