Velké procento zdravotnického SW je k dispozici pouze pro Windows, protože je to velmi rozšířený OS, HW (i ten medicínský) podporují prakticky všichni výrobci, má široké a stabilní API, dobrou dokumentaci a kvalitní vývojové nástroje. Přitom nejde jen o psaní "čistých" desktopových aplikací, ve kterých se vývojářskému komfortu Windows těžko konkuruje. Důležitá je také široká nabídka third party komponent. Pokud potřebujete například podporu pro zobrazování DICOM (řekněme standardní kontejner pro medicínské obrázky, včetně vícerozměrných, psaný se přihlédnutím ke specifikům RTG, CT a MRI), tak si koupíte za pár dolarů komponentu. Podobně seženete komponenty pro prakticky cokoliv dalšího, co při psaní aplikace potřebujete.
Ohledně děravosti SW: v roce 2016 měl jen kernel Linuxu 217 vulnerabilities, nemluvě o distrech. Celé Windows 10 jich měly 172. A vyjma Linuxu už moc alternativ není, protože z důvodu nákladů potřebujete, aby to jelo na levném x64 HW.
http://www.cvedetails.com/top-50-products.php?year=2016