Narazil jste na to. Pro stávající NEGUI aplikace se nevyplatí přecházet na nové konfiguráky. Znám pořádně jen Postgres a tam je konfigurace +/- stabilní 10 let. Konfigurák sám v sobě obsahuje komentáře, varianty - tj. metadata. Většina stávajících serverů má validační režim, tj. nemusíte restartovat server, ale jen se zeptáte jestli je aktuální konfigurace správná. Nevidím důvod proč přecházet na novou syntax. A nejde o lenost programátorů, přepsat parser je práce na dva dny.
GUI aplikace ale většinou už konfiguráky v xml mají. Podívejte se do ./gnome2 adresáře. Některé včetně metadat.