Díky, Loli, smazal jsem tedy ~/.config/google-chrome/Default.
Teď by bylo poměrně vtipné, kdyby v novém čistém Chrome po přihlášení ke Google účtu při automatické synchronizaci z Google Drive (nebo odkud) zpět ke mně všech nastavení došlo i k re-importu toho malware.
Ostatně dokud nebudu vědět, kde se to skutečně v Chrome ukrývalo, nebudu si ani jistý, že při synchronizaci k tomu opravdu nedošlo.