Můj názor na Avogadro není zcela aktuální, ale kromě problému se stabilitou, který mě zas tak netrápil, bych spíš považoval za problém import a export různých formátů, při kterém je schopen úplně zmatlat strukturu molekuly do naprosto nepochopitelných konstitucí. Také mi dost nevyhovuje to žalostné základní nastavení barev, které se rádo i měníva po načtení souborů. Stylem ovládání mi to připomíná Chem3D od Cambridge Softu, nebylo by to špatné, ale spousta těch chyb je zásadní.