Na diagramy je Dia nebo třeba v OODraw. Podstata yEdu – a je to opravdu povedený program – je v tom, že pracuje s GRAFY (v matematickém slova smyslu, tj. hrany, vrcholy). Nekreslíte tedy nějaké obrázky, ale schéma, kterému program „rozumí“ a se kterým dokáže zajímavě pracovat – dalo by se to přirovnat k programu pro návrh elektronický obvodů. Že má pro reprezentaci vrcholů různé obrázky je jen třešnička na výborném dortu.