Lua je fajn, ale možná narazíš ve chvíli, kdy budeš potřebovat nějakou další knihovnu. Samozřejmě je to řešitelné třeba přes LuaRocks (a LuaJIT má přímé rozhraní na nativní knihovny než klasický interpret), ale pip ekosystém je IMHO o dost rozsáhlejší. V rychlosti rozdíly nebudou ve chvíli, kdy všechno poběží na CUDA.