Mam docela podobnou zkusenost. Nebo to nebylo stabilni.
Na autory Wine se clovek za to zlobit nemuze, reimplementovat neco tak komplexniho, jako je Windows API, je proste silene.
Spis si fakt rikam, jakou to ma cenu, kdyz pro spoustu programu existuje Linuxova alternativa (a vice a vice aplikacich je multiplatformnich - osobne pouzivam Linux, MacOS a obcas Windows, vetsinu dulezitych aplikaci mam na vsech platformach) , nebo je mozne Windows aplikace snadno spustit ve VM.