Certifikační autorita Let’s Encrypt informuje o sporu s firmou Comodo působící ve stejném oboru. Comodo se snaží zaregistrovat nejméně tři ochranné známky obsahující spojení Let's Encrypt, včetně samostatného Let's Encrypt. Žádosti byly podány v říjnu minulého roku, tedy dlouho poté, co spojení začala používat skupina ISRG právě pro bezplatnou certifikační autoritu.
Od března 2016 jsme společnost Comodo opakovaně žádali, aby žádosti stáhla, přímo i přes právníky, ale byli jsme odmítnuti. (…) Pokud to bude nezbytné, budeme tuto značku, na které jsme tvrdě pracovali, s vervou bránit,
píše se ve vyjádření Let's Encrypt. Organizace dodává, že doufá ve smírné řešení, protože by ráda věnovala čas a prostředky prospěšnějším věcem.