Oboje má svoje. Nicméně:
* Pamatuju si celkem GIMP s oknem na cokoli. Defaultně dostal člověk toolwindow, na každý obrázek dostal další okno a třeba na vrstvy další okno.
* Později (asi od 2.0) umožnil GIMP spojit více oken do jednoho. (Nebo to možná dříve nebylo defaultně a nevšiml jsem si toho.) To bylo příjemné.
* Od nějaké verze začala nástrojová okna zaclánět i ve chvíli, kdy neměla focus. Celkem vopruz a tady jsem se začal těšit na single-window-mode.
Nicméně, tabulátor zaclánějící okna řeší, jak tu někdo psal.