Řada vývojářů v MySQL nepovažuje storage engines právě za šťastný nápad – pokud sledujete vývoj a blogy v „Planet MySQL“. Díky tomu dodnes není pro MySQL k dispozici jediný bezproblémový univerzální storage. InnoDB je kvalitní, ale nepodporováno fulltextem, MyIsam neposkytuje konzistenci – Falcon a MariaDB jsou v dlouhodobém beta stadiu.