Je to popsané v tom odkazovaném článku o Debianu. Jde o to, že ve výstupu (binárce) jsou často věci jako čas kompilace, cesta k některým souborům, informace o hardware používaném při kompilaci nebo třeba náhodné číslo. Výsledek ovlivňuje i pořadí souborů na disku, protože při kompresi se sestaví jiný slovník a archivy se komprimují jinak. Pak není možné sestavit na bit stejný balíček. Tohle všechno se musí vyřešit.