Vývoj komerčního systému SkyOS je už několik měsíců zastaven a vývojáři zvažují, co bude dál. Jedním z hlavních důvodů problémů SkyOS je nedostatek kvalitních ovladačů, který výrazně komplikuje vývoj. V aktuální zprávě na webu projektu píše autor Robert Szeleney, že experimentuje s jádry Linux a NetBSD, které jsou pokročilejší než jádro SkyOS a proto by jej mohly v budoucnu nahradit. Z hlediska uživatele by se ovšem nic nezměnilo, celé GUI systému by se jen přeneslo nad nové jádro, o kterém by uživatel vůbec nevěděl. Výsledkem by byla široká podpora hardware a vývojáři by se mohli soustředit na práci na samotném systému.