journald je hlavně sběr logů a nikoliv jejich archivace, ač tu také nějak umí.
Tvůj popis ukazuje, že vlastně nemáš problém s journald, ale s návrhem aplikace, zkus se zaměřit spíše na tohle, ušetříš si spousty energie běháním proti zdi. To nemyslím nijak zle, ale občas je dobré se zastavit a podívat se, jestli ty problémy neřešíš zbytečně.