Za mě jsem na to narazil u Truecrypt (dneska Veracrypt) kontejnerů, kdy třeba na 32GB flashce chcete nechat polovinu nešifrovanou, a na druhou polovinu vypadá nejjednodušší vytvořit soubor (protože je s ním nejjednodušší práce) s šifrovaným kontejnerem. Tak to je na FAT32 problém, 4GB velikost kontejneru je dost limitující, a nelze dělat kontejner na více částí (teda dřív to nešlo).